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iXon SRRF-Stream
SRRF-Stream?是一種全新的實(shí)時(shí)超分辨顯微功能，僅支持在Andor iXon Life 和iXon Ultra EMCCD 相機(jī)上實(shí)現(xiàn)此功能。
全新 SRRF-Stream 超分辨
應(yīng)用于物理和生命科學(xué)的智能和多模式光譜平臺(tái)
- 實(shí)時(shí) –?加強(qiáng)工作流程，采集處理同時(shí)進(jìn)行，避免后續(xù)再處理過程。在“實(shí)時(shí)模式”中查看。
- 低激發(fā)光強(qiáng)度(mW-W/cm2) – 獲得更長的活細(xì)胞觀察時(shí)間和更精確的生理機(jī)能。
- 使用傳統(tǒng)的熒光染料，如GFP – ?簡單標(biāo)記，無光控轉(zhuǎn)換要求。
- 活細(xì)胞動(dòng)力學(xué) ?– ?每1-2秒全視野超分辨成像。使用ROI時(shí)> 10 fps。
- 高性價(jià)比 – 升級(jí)傳統(tǒng)熒光顯微鏡（寬場(chǎng)、全內(nèi)反射(TIRF)、轉(zhuǎn)盤式共聚焦）到超分辨顯微鏡。
iXon SRRF-Stream比較
線粒體
有絲分裂
圖像為熒光標(biāo)記U2OS細(xì)胞系，由Andor Dragonfly轉(zhuǎn)盤共聚焦顯微鏡拍攝，圖像比較了iXon Life 888 EMCCD相機(jī)關(guān)閉和打開SRRF-Stream模塊的效果。拍攝條件為：63X物鏡、2X光學(xué)放大、 488nm照明。有絲分裂紡錘體結(jié)構(gòu)上可以明顯觀察到分辨能力的大幅提升。通過該區(qū)域的線陣強(qiáng)度剖面圖對(duì)比進(jìn)一步證明了這一點(diǎn)。
*U2OS細(xì)胞系被固定后，用抗α-微管蛋白抗體（綠色，AF488）和鬼筆環(huán)肽（紅色，羅丹明）染色來顯現(xiàn)肌動(dòng)蛋白，細(xì)胞核由DAPI染色。樣品由Klebanovych A., Laboratory of Biology of Cytoskeleton, IMG of the AS CR, v.v.i.提供。
SRRF vs SIM
抗NS5A染色的HCV感染的細(xì)胞。上圖分別為寬場(chǎng)，結(jié)構(gòu)光照明超分辨成像（SIM）技術(shù)和SRRF成像技術(shù)（SRRF寬場(chǎng)成像）拍攝的圖像。圖像是用同一個(gè)顯微鏡拍攝細(xì)胞的同一區(qū)域，并使用相同的物鏡和光路。唯一不同的是SIM由一臺(tái)6.5um像素的sCMOS記錄，而寬場(chǎng)和SRRF超分辨由一臺(tái)16um像素的iXon EMCCD記錄。SRRF出眾的分辨能力顯而易見，可輕松提供傳統(tǒng)的衍射極限2倍以上的分辨率，而SIM理論上受限于設(shè)計(jì)原理，只能達(dá)到低于2倍的傳統(tǒng)衍射極限分辨率提升。實(shí)驗(yàn)樣品由UCL的Grove實(shí)驗(yàn)室提供。
有絲分裂 2
進(jìn)行有絲分裂時(shí)的哺乳動(dòng)物細(xì)胞。藍(lán)色代表DNA染色，綠色為微管，紅色為動(dòng)粒。左圖顯示了寬場(chǎng)Z 序列， 右圖是相同條件下啟用SRRF的Z系列圖像。 樣品由華威大學(xué)Phil Auckland提供，在倫敦大學(xué)學(xué)院（UCL）的Henriques實(shí)驗(yàn)室成像。
BCS-40 膜
細(xì)胞標(biāo)志物標(biāo)記的BSC-40活細(xì)胞的200秒延時(shí)圖像，激發(fā)光為635nm LED照明系統(tǒng)。前100幀對(duì)應(yīng)于曝光時(shí)間為1秒的寬場(chǎng)成像；第二個(gè)100幀對(duì)應(yīng)于SRRF-Stream成像，其中每幀由50幅圖像（20ms曝光時(shí)間）的SRRF-Stream處理產(chǎn)生。樣品由David Albrecht提供（UCL 的 Ricardo Henriques和Jason Mercer 實(shí)驗(yàn)室）。
網(wǎng)絡(luò)蛋白微結(jié)構(gòu)
絡(luò)蛋白微結(jié)構(gòu)-SRRF.png)
mCherry標(biāo)記的HeLa活細(xì)胞的網(wǎng)格蛋白微結(jié)構(gòu)圖像比較，由2 FPS的寬場(chǎng)顯微鏡拍攝。每100幅原始“輸入”圖像生成為一幅超分辨圖像，單幅超分辨圖像的速率為2 FPS。通過SRRF-Stream圖像的小區(qū)域線陣強(qiáng)度剖面，表明SRRF有能力分辨相隔150nm的結(jié)構(gòu)。樣品由Caron Jacobs 提供（UCL 的Ricardo Henriques 和 Mark Marsh 實(shí)驗(yàn)室 ）。
酵母
Life Act表達(dá)染色的裂殖酵母，圖中為3D投影蒙太奇法比較。在相同的曝光時(shí)間下，標(biāo)準(zhǔn)寬場(chǎng)與SRRF-Stream 寬場(chǎng)成像的比較。 樣品由Mohan Balasubramanian實(shí)驗(yàn)室（U. Warwick）和Gautam Dey（UCL的Buzz Baum實(shí)驗(yàn)室）提供。
血液
血小板、紅膜、綠色內(nèi)部顆粒的標(biāo)準(zhǔn)寬場(chǎng)和SRRF寬場(chǎng)成像比較。樣品由UCL的Cutler實(shí)驗(yàn)室提供。
微管蛋白
仍然是表達(dá)微管蛋白GFP的Hela活細(xì)胞寬場(chǎng)成像，同一區(qū)域SRRF-Stream實(shí)際延時(shí)幀頻1fps（SRRF-Stream使用20ms曝光時(shí)間/幀頻50）。樣品由David Albrecht提供（UCL 的Ricardo Henriques和Jason Mercer實(shí)驗(yàn)室）。
iXon SRRF-Stream應(yīng)用
SRRF-Stream超分辨模塊突破了傳統(tǒng)的衍射極限。此外，使用非復(fù)雜樣品標(biāo)記、結(jié)合傳統(tǒng)成像設(shè)備和低強(qiáng)度照明即可實(shí)時(shí)實(shí)現(xiàn)超分辨成像，為觀察活細(xì)胞結(jié)構(gòu)和實(shí)時(shí)運(yùn)動(dòng)創(chuàng)造條件，并以更低的光損傷實(shí)現(xiàn)時(shí)空分辨率。
SRRF-Stream的觀測(cè)能力
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SRRF-Stream應(yīng)用
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iXon SRRF-Stream工作流程優(yōu)勢(shì)
SRRF技術(shù)由倫敦大學(xué)學(xué)院里卡多·亨里克博士（Ricardo Henriques）的實(shí)驗(yàn)室開發(fā)，Andor通過引入SRRF技術(shù)并與Henriques博士密切合作，加強(qiáng)了在iXon EMCCD相機(jī)上的優(yōu)化運(yùn)行。 Andor也是高級(jí)GPU處理優(yōu)化技術(shù)的專家，基于此的SRRF算法，比現(xiàn)有的基于ImageJ的SRRF（NanoJ-SRRF）后處理執(zhí)行快30倍。通過允許數(shù)據(jù)采集和SRRF處理并行操作，顯著的加速使工作流程得到優(yōu)化。
處理速度的比較 - SRRF Stream vs NanoJ-SRRF
- 輸入圖像像素 - 1024 x 1024
- 每個(gè)SRRF圖像輸入拍攝圖像數(shù) - 100
- 輸出SRRF像素 - 4096 x 4096
- NVidia GTX 1080 GPU卡
該圖比較100幅原始輸入圖像塊（1024 x 1024像素）的處理速率，以產(chǎn)生4096 x 4096像素的合成SRRF超分辨率圖像。將SRRF-Stream與NanoJ-SRRF進(jìn)行比較，處理發(fā)生在相同的Nvidia GTX 1070 GPU卡上。與NanoJ-SRRF相比， SRRF-Stream加速允許數(shù)據(jù)采集和處理同時(shí)進(jìn)行，能夠進(jìn)一步改善工作流程。
由于如今數(shù)據(jù)處理速度比相機(jī)拍攝速度快得多，內(nèi)置SRRF-Stream功能的相機(jī)可以實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)超分辨，能得到大視野超分辨圖像。
在我們自己的實(shí)驗(yàn)室中全面的測(cè)試了SRRF-Stream，我們對(duì)他的工作流程以及使用更大視野得到活細(xì)胞超分辨率的能力印象深刻。通過將SRRF算法與高性能的iXon結(jié)合，我們完成了用于熒光顯微鏡的超分辨率相機(jī)。
里卡多·亨瑞克博士
定量成像和納米生物物理學(xué)博士
iXon SRRF-Stream使用
為使用SRRF-Stream需要哪些配置？
- SRRF-Stream兼容的iXon Life或iXon Ultra EMCCD
- SRRF-Stream許可證和安裝程序
- 與CUDA兼容的NVidia GPU卡*
- MicroManager軟件（64位）或Andor SDK2（64位）
- 可選：PC工作站 - 預(yù)裝了經(jīng)過推薦和測(cè)試的GPU卡，以及支持SRRF-Stream的MicroManager（鏈接到iXon相機(jī)的序列號(hào)）和帶有SRRF-Stream的Andor SDK2
* Nvidia GPU卡應(yīng)具有V3.0或更高版本的能力以及4GB或更高版本的GPU內(nèi)存。請(qǐng)注意，Andor使用“中檔”GTX 1070 進(jìn)行了大量測(cè)試，發(fā)現(xiàn)SRRF-Stream處理數(shù)據(jù)的速度遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于iXon相機(jī)采集圖像的速度。
我可以將iXon相機(jī)升級(jí)到SRRF-Stream嗎？.png)
如果您目前擁有iXon 888，iXon 897，iXon Life 888或iXon Life 897型號(hào)，Andor可以升級(jí)您的相機(jī)以獲得SRRF-Stream超分辨率顯微鏡功能。
- 在升級(jí)申請(qǐng)表中提供您的序列號(hào)
- 銷售工程師將對(duì)PC和GPU的要求提供建議
- 下訂單
- 接收iXon序列號(hào)的SRRF-Stream升級(jí)包（安裝程序和許可證）
請(qǐng)注意：如果升級(jí)iXon 888型號(hào)，您還需要請(qǐng)求SRRF-Stream相機(jī)優(yōu)化過程?SRRF-Stream相機(jī)優(yōu)化過程。
MicroManager集成
為了使SRRF-Stream廣泛使用，它已經(jīng)完全集成到MicroManager（開源成像軟件）開放資源顯微鏡軟件平臺(tái)中。
- 在實(shí)時(shí)模式下輸出實(shí)時(shí)超分辨率圖像
- 多維度——集成多通道，Z-stack和時(shí)間序列采集
- SRRF-Stream參數(shù)可以通過“設(shè)備屬性瀏覽器”與其他像機(jī)參數(shù)一起進(jìn)行調(diào)整
其他資源
學(xué)習(xí)中心提供廣泛的教學(xué)視頻，技術(shù)文章和網(wǎng)絡(luò)研討會(huì)，以指導(dǎo)您完成所有成像需求的產(chǎn)品系列。下面的鏈接是我們?nèi)律蟼鞯馁Y料，您可以從這些資料開始了解。
- 技術(shù)文章：?“SRRF: Universal live-cell super-resolution microscopy” (DOI 10.1016/j.biocel.2018.05.014)
- 技術(shù)文章：SRRF-Stream - Real-Time Super-Resolution in a Camera
- 技術(shù)文章： SRRF-Stream Upgrade - Boost your Current iXon EMCCD with Super-Resolution Capability
- 網(wǎng)絡(luò)研討會(huì)?：NanoJ-SRRF和SRRF-Stream： 適用于大多數(shù)現(xiàn)代顯微鏡及常規(guī)熒光標(biāo)記的快速活細(xì)胞超分辨技術(shù)
- 產(chǎn)品紀(jì)要：優(yōu)化SRRF-Stream性能
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